از مهم ترين چالش هاي امروزه مديريت آب مي توان به موارد: 1 - عدم در نظر گرفتن مديريت تقاضا 2 - بي توجهي به نرخ اقتصادي آب 3 - نبود طرح مشخص سرمايه گذاري براي استفاده مجدد از فاضلاب 4 - مشكلات و موانع مربوط به عمليات اجرايي و نگهداري پروژه هاي آب 5 - اتلاف زياد آب در شبكه هاي تامين آب شهري اشاره نمود. از جمله راه هاي برون رفت از موارد ذكر شده مي توان به موارد: 1 - داشتن يك چارچوب منسجم براي منابع آب 2 - داشتن سيستم هاي مديريت اطلاعات 3 - مديريت كيفيت آب 4 - افزايش راندمان تخصيص و مصرف آب 5 - ترويج نقش بخش خصوصي در ابعاد مختلف مديريت آب 6 - سياست هاي قيمت گذاري بر پايه روش هاي بهبود هزينه 7 - ممانعت از استخراج آب هاي زيرزميني 8 - مشاركت مردم 9 - توسعه ساختار مديريت آب اشاره نمود.